 Le substrat dans lequel pousse la plante est important afin d’obtenir de grands rendements. C’est le substrat qui va servir autant à tenir la plante qu’à distribuer les nutriments au niveau des racines. Il y a deux grands types de substrats : Les substrats inertes : Laine de roche, Coco (substrat simple 100% Organique), Billes d’argiles, ce sont en général des substrats sans nutriments, et sans minéraux ou très peu. Les terres ou substrats organiques : Les terres sont des subtrats vivants, elles contiennent des micro-organismes qui favorisent la vie et la symbiose des racines dans le sol. Le coco est egalement un substrat totalement organique, simple composant puisqu’il n’y a que du coco, la terre elle, est un substrat complexe, elle contient divers composants (Humus, Perlite, Tourbes, Sphaignes, etc…), dont des aliments.
Les terres de germination sont dépourvues d'engrais, afin d'éviter de brûler les graines et boutures.
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